L’Institut Islamique Al-Azhar au Sénégal a évolué d’un simple institut d’études islamiques à une fondation dotée d’une administration générale autonome, chargée de superviser l’ensemble de ses activités académiques, administratives et financières. Son siège est situé à Dar es Salaam, Ndam.
L'administration générale est dirigée par un président permanent, traditionnellement l'aîné des fils du fondateur, Cheikh Muhammad al-Murtada Mbacké. Cette administration est composée de :
L’Administration Générale comprend cinq départements, chacun subdivisé en plusieurs bureaux :
Bureau d'Inspection Financière et Comptabilité
Bureau de Conservation et Entretien des Biens
Bureau des Projets et Investissements
Bureau d'Activation et Organisation Culturelles
Bureau de Recherche et Publications
La Conférence Générale est un organe consultatif qui se réunit tous les deux ans pour évaluer la situation de la Fondation et formuler des recommandations.
Les participants sont :
Membres de l'Administration Générale
Directeurs des succursales principales
Trois enseignants représentants de chaque centre
Quatre représentants de l'Office National des Parents d'Élèves
Invités sélectionnés par l'Administration Générale
Si le quorum n'est pas atteint lors de la première convocation, une seconde réunion est organisée dans les deux semaines suivantes, sans exigence de quorum. Le Directeur Général ou son délégué préside les travaux de préparation de la Conférence Générale.